Danh sách các đội bóng được cấp phép gồm: Nam Định (đầu bảng V.League), Hà Nội, Thể Công – Viettel, Hồng Lĩnh Hà Tĩnh, Công An Hà Nội, Đông Á Thanh Hóa, Hoàng Anh Gia Lai, Becamex Bình Dương, Thành phố Hồ Chí Minh, Quảng Nam và SHB Đà Nẵng.
Việc các đội bóng này đáp ứng đầy đủ các yêu cầu của AFC không chỉ thể hiện sự chuyên nghiệp trong công tác quản lý, tài chính và tổ chức, mà còn giúp bóng đá Việt Nam có thêm cơ hội khẳng định vị thế trên đấu trường quốc tế. Đây cũng là điều kiện cần thiết để các câu lạc bộ có thể thi đấu một cách hợp lệ và hiệu quả ở các giải đấu cấp CLB châu Á.
Bên cạnh đó, có 4 đội bóng không được cấp giấy phép AFC do không hoàn thành thủ tục hoặc tự rút lui khỏi quy trình đăng ký. Những câu lạc bộ này bao gồm PVF-CAND, Phù Đổng Ninh Bình, Sông Lam Nghệ An và Quy Nhơn Bình Định. Do đó, họ sẽ không thể tham gia các giải đấu AFC mùa giải 2025/26.
